明末三大案，又称晚明三大疑案，即明朝末期宫廷中发生的梃击案、红丸案、移宫案的总称。这三起事件本身并不是很重要，但是却标志着明末纷乱和衰亡的开始，故有“三大案”之称。
一、梃击案
梃击案是发生在万历四十三年的一场有关太子朱常洛被刺杀的政治事件。
当时，万历帝的皇后无子嗣，王恭妃生子朱常洛，郑贵妃生子朱常洵。开始，因郑贵妃得宠，万历帝想违背“立嗣立长”的祖训，册立朱常洵为太子，引发国本之争，遭到朝中大臣和东林党的反对，不得已只好册立朱常洛为太子。
后来有个叫张差的人，手持木棒闯入太子的居所——慈庆宫，并打伤了守门太监。张差被审时，供出是郑贵妃手下太监庞保、刘成引进的。时人怀疑郑贵妃想谋杀太子，但皇帝不愿深究，最后以疯癫奸徒罪将张差处以凌迟。又在宫中密杀了庞保、刘成二太监，以了此案。
张差梃击案背后主使是不是郑贵妃已无定论，也有人怀疑是太子自演自导的一出苦肉计，目的是借此陷害郑贵妃。而梃击案真相究竟如何，恐怕无人知晓了。梃击案遂成为晚明三大疑案之一。
二、红丸案
泰昌元年，泰昌帝病重，李可灼进献红丸，自称仙丹，泰昌帝服后死去，是为“红丸案”。
万历帝去世后，太子朱常洛即位，郑贵妃为保全自己，取悦新帝，从侍女中挑选了8名能弹会唱的美姬进献给泰昌帝，泰昌帝全部笑纳。本来泰昌帝以为新君继位，会有一番作为，不想登基大典后仅十天，就一病不起。
身体本已虚弱的泰昌帝决计服用李可灼进的红丸。初服一丸，四肢和暖，思进饮食，泰昌帝的病好似一下子被驱走了一半。两天来，他除了时常坐在龙案前养神外，居然还有两次走出了殿门。三天后，泰昌帝又服一丸，结果在当天夜里猝然死去。
关于泰昌帝的死因，有人说是服红丸而死，也有人说与红丸无关；有人说是惑于女宠，是郑贵妃有意加害，也有人说是劳累所致。红丸案，一直争吵了8年，成为天启朝党争的题目之一。三百余年来，史学家设想了种种答案，但没有一种令人信服，因此红丸一案成了千古之谜。
三、移宫案
移宫案，为明末三大案之一。朱常洛登基后宠妃李选侍照顾皇长子朱由校迁入乾清宫。不到一个月后，朱常洛死于红丸案。李氏与太监魏忠贤密谋，欲居乾清宫，企图挟皇长子自重。都给事中杨涟、御史左光斗等，为防其干预朝事，逼迫李选侍移到仁寿宫哕鸾宫。李选侍万般无奈，怀抱所生八公主，仓促离开乾清宫，移居仁寿宫内的哕鸾宫，此事件史称“移宫案”， 此案议论颇多，后来成为派系斗争的代名词。其与万历朝的梃击案、泰昌朝的红丸案，并称“晚明三大疑案”。
