一、对包衣种子处理不当
种子包衣剂一般由化学杀菌剂和染色剂配比而成。因此，包衣的种子，浸种时如果处理不当，就会出现不发芽或发芽不齐的问题。对这类种子，浸种前最好用35℃的温水浸泡15分钟左右，而后用手轻轻地将种子上的种衣剂洗净，再进行浸种、催芽。
二、浸种时水温过高
温汤浸种具有一定的杀菌作用。甜瓜温汤浸种的最适温度为50℃~55℃，温度过高会烫伤种子。甜瓜温汤浸种应注意以下两点：一是严格掌握浸种的用水量，一般用水量是种子量的5~6倍；二是浸种过程要不断搅动，待水温下降到25℃~30℃时保持恒温浸种4~6小时，然后取出种子，搓去种皮上黏液，用清水冲洗2~3遍再用湿布包好，在28℃~30℃条件下催芽。
三、包裹种子用的布太湿
有些农民因怕种子发芽后的胚根扎入布中伤根，往往用平纹布包裹种子；有人又
恐怕发芽的水分不够充足，就将布浸得湿湿的，再包裹种子，这些做法容易使种子由于缺少氧气而发生窒息。故包裹种子要用干净拧干的湿毛巾将浸泡好沥干水分的种子平摊包好，既保温，通透性也好，有利于种子发芽。
四、催芽温度要适宜
甜瓜催芽时间一般为20~24小时，催芽适温为28℃~32℃。切忌温度过高。若用电热毯加热催芽，要随时观察温度，并翻动种子。以免温度过高导致种子蒸熟而不发芽和种子受热不均而发芽不齐。
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